Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCAP28676 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCAP28676 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCAP28676 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GCAP28676 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCAP28676 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms