Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX2P28328 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PEX2P28328 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms