Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms