Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms