Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms