Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRGP23470 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
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