Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms