Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1P21675 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1P21675 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1P21675 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1P21675 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1P21675 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1P21675 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms