Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NF1P21359 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NF1P21359 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NF1P21359 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NF1P21359 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms