Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCP20941 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCP20941 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCP20941 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCP20941 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCP20941 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCP20941 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCP20941 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms