Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB1P20618 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms