Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5AP20339 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms