Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF1BP20333 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms