Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms