Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD53P19397 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms