Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms