Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF3P17036 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF3P17036 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms