Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB3P16520 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB3P16520 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB3P16520 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms