Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms