Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms