Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms