Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms