Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2P10911 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2P10911 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2P10911 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2P10911 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms