Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms