Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms