Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAA1P0DJI8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms