Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms