Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P0C879 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P0C879 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P0C879 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P0C879 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P0C879 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms