Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms