Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VIL1P09327 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms