Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPBP07199 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPBP07199 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPBP07199 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPBP07199 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPBP07199 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPBP07199 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPBP07199 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPBP07199 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms