Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PF4P02776 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PF4P02776 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4P02776 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4P02776 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4P02776 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4P02776 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4P02776 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms