Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX58O95786 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX58O95786 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX58O95786 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX58O95786 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX58O95786 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX58O95786 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms