Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms