Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC2O95347 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC2O95347 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC2O95347 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC2O95347 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC2O95347 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC2O95347 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC2O95347 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC2O95347 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC2O95347 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC2O95347 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC2O95347 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms