Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3JO75822 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF3JO75822 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3JO75822 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3JO75822 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3JO75822 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3JO75822 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms