Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 KIAA1551-207ENST00000541981 674 ntTSL 215.3■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 415.02■□□□□ -02e-9■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 KIAA1551-206ENST00000540924 362 ntTSL 213.96□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.356e-15■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 KIAA1551-204ENST00000535596 965 ntTSL 24.86□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 KIAA1551-203ENST00000397578 814 ntTSL 34.75□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.191e-7■■■■■ 142.2
SF3B1O75533 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 142.1
SF3B1O75533 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 142.1
SF3B1O75533 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 58.32□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)6.19□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 56.04□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 524.29■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 319.76■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 319.55■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 219.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 142
SF3B1O75533 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 315.14■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 517.71■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.296e-12■■■■■ 141.9
SF3B1O75533 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.262e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 524.11■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 SSU72-203ENST00000378725 619 ntTSL 220.27■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 CPEB1-203ENST00000567678 557 ntTSL 420.09■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 517.05■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 217.05■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 CPEB1-202ENST00000566716 502 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-7■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 315□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 CPEB1-201ENST00000563519 536 ntTSL 414.65□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 57.29□□□□□ -1.248e-11■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 141.7
SF3B1O75533 GDPD5-213ENST00000532435 825 ntTSL 524.57■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 141.6
SF3B1O75533 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 141.6
SF3B1O75533 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 415.46■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 141.6
SF3B1O75533 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 141.6
SF3B1O75533 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.773e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 519.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 141.5
SF3B1O75533 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.445e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 141.4
SF3B1O75533 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 141.3
SF3B1O75533 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 141.3
SF3B1O75533 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 141.3
SF3B1O75533 IMPDH1-207ENST00000469328 2295 ntTSL 514.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 141.3
SF3B1O75533 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 212.54□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 28.1□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 141.1
SF3B1O75533 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 212.55□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 141
SF3B1O75533 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 140.9
SF3B1O75533 NSMCE2-203ENST00000517532 841 ntTSL 510.49□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 140.9
SF3B1O75533 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 140.9
SF3B1O75533 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 140.9
SF3B1O75533 ARHGAP21-209ENST00000472150 675 ntTSL 318.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 140.7
SF3B1O75533 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 515.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 140.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1326.6 ms