Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms