Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAP30O75446 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms