Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms