Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GMDSO60547 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMDSO60547 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GMDSO60547 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms