Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO1BO43795 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO1BO43795 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms