Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms