Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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