Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms