Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VGFO15240 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VGFO15240 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGFO15240 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGFO15240 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGFO15240 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGFO15240 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGFO15240 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGFO15240 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGFO15240 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VGFO15240 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGFO15240 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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