Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIMBP2O15034 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMBP2O15034 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms