Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASKO14936 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASKO14936 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASKO14936 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASKO14936 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms