Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F3O00716 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F3O00716 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F3O00716 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F3O00716 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F3O00716 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms