Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PODXLO00592 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PODXLO00592 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PODXLO00592 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PODXLO00592 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PODXLO00592 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms